بررسی بیوانفورماتیکی و تجربی امکان وجود mirna اینترونی در ژن p75ntr انسانی
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
- نویسنده سپیده پارسی
- استاد راهنما بهرام محمد سلطانی سید جواد مولی
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
نروتروفین ها دامنه وسیعی از فعالیت ها را در سلول نشان میدهند.p75ntr ، یکی از گیرنده های مهم نوروتروفین هاست که مسیر سیگنالینگ آن بدرستی مشخص نیست. این ژن هم به عنوان تومورساپرسور و هم افزایش دهنده متاستاز در بدخیمی ها معرفی شده است. گر چه دخالت برخی mirna ها در سرطانها معلوم شده است ولی دخالت mirnaها در این مسیر بخصوص که از p75ntr میگذرد مشخص نیست. در این تحقیق با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی و روش های تجربی موفق شدیم حضور یک mirna را در اینترون چهارم این ژن را نشان داده و افزایش تولید این mirna را بعد از انتقال پیش ساز مربوطه به سلولهای hela نشان دهیم. ژن p75 برای مدت زمان کوتاهی در سلولهای خاص بیان دارد ولی بیان ان در سلولهای گلیومایی طولانی تر است. در این تحقیق بیان این mirna در سلولهای سرطانی گلیومایی به همراه بیان ژن p75 نیز نشان داده شد که احتمالا بیانگر اشتراک پراموتر انهاست.همچنین به صورت بیوانفورماتیکی نیز ارتباط عملکردی p75 و mir اینترونی آن نشان داده شد. حضور یک mirna اینترونی که تحت پروموتر p75 کد میشود پیچیدگی مسیر سیگنالینگ p75 را افزایش میدهد ولی میتواند یکی از عوامل دخیل در رفتار دوگانه p75 قلمداد شود. از آنجاییکه p75 در نقاط حساسی از نمو سلولهای عصبی بیان میشود، حفظ چنین mirna ای در یک اینترون نسبتا کوتاه بیانگر نقش احتمالا مهم ان در تکامل سیستم عصبی پستانداران است.
منابع مشابه
بررسی وجود mirna در اینترون های ژن trkc انسانی و تأثیر بیش بیان آن بر ژن های هدف احتمالی
با توجه اهمیت و عملکردهای مهم mirnaها، شناسایی mirnaهای جدید و نقش آن ها ما را در درک بهتر فرایندهای داخل سلولی یاری می کند. بنابراین استفاده از روش هایی که قادر باشد ما را سریعتر به این مهم برساند ضروری است. رویکردهای کامپیوتری بر اساس ویژگی های ساختاری، حفظ شدگی در طول تکامل و همچنین میزان انرژی آزاد ساختارهای پیش بینی شده طراحی شده اند. در این رویکردها از چندین نرم افزار و سایت به موازات هم ...
بررسی امکان وجود رابطهای قابلفهم میان «طرح مفهومی» و «محتوای تجربی»
استدلال دیویدسن علیه اعتبار تمایزِ «طرح مفهومی» و «محتوای تجربی»، یا بهاصطلاح «جزم سوم تجربهگرایی» بحثهای فراوانی را برانگیخته است. دو ایراد کلی به دیدگاه دیویدسن از این قرار است: ۱. بر خلاف ادعای دیویدسن، استدلالهای او «اصل ایدۀ یک طرح مفهومی» را مردود نمیشمارد، بلکه انتقادهای او صرفاً به برداشت خاص کواین از «طرح مفهومی» وارد است. ۲. کل استدلالهای دیویدسن مبتنی بر آموزههای معناشناختی او ا...
متن کاملبررسی ارتباط فیلوژنتیکی نواحی اینترونی و اگزونی ژن ACC، در گونههای مختلف جو بومی ایران
جنس جو متعلق به طایفه Triticeae از خانواده گندمیان تکلپه، است. ژن تک کپی پلاستیدی استیل کوآنزیمآ کربوکسیلاز، آنزیمی اساسی در سنتز اسیدهای چرب در پروکاریوتها و یوکاریوتها میسازد و اهمیت این آنزیم در شروع واکنش سنتز اسیدهای چرب میباشد. این ژن از توانایی بالایی، جهت تجزیههای فیلوژنتیکی، تکاملی و سیستماتیکی گراسها برخوردار میباشد. در این آزمایش، برای اولین بار، رابطه فیلوژنتیکی هشت گونه و ...
متن کاملپیش بینی بیوانفورماتیکی mirna های هدف گیرنده ژن های hbx و notch۱ در هپاتوسلولار کارسینوما ناشی از هپاتیت bمزمن
چکیده زمینه و هدف: هپاتوسلولار کارسینوما(hcc) سومین عامل اصلی مرگ ناشی از سرطان در سراسر جهان محسوب می شود. ویروس هپاتیت b و ژن hbx آن به واسطه تداخل در مسیرهای سیگنالینگ نقش بسیار مهمی در پیشرفت سرطان hcc دارند. هم چنین به دلیل عدم وجود علائم بالینی در مراحل اولیهی ابتلا، ضرورت شناسایی مارکرهای اختصاصی با حساسیت بالا جهت شناسایی زود هنگام افراد مبتلا به hcc احساس می گردد. از سوی دیگر، با پیشر...
متن کاملشناسایی وتشخیص ژن های mirna در خانواده نشخوارکنندگان بر اساس روش های بیوانفورماتیکی و اعتبار سنجی آزمایشگاهی آن
شناسایی ژن های میکرو آر ان ای از اهمیت ویژه ای برخوردار است. توسعه روش های محاسباتی و متعاقبا صرفه جویی در هزینه و زمان پژوهش های آزمایشگاهی، تاثیر بسزایی در افزایش سرعت و دقت شناسایی آنها دارد. با توجه به اینکه زمان کمی از شناخت میکرو آر ان ای ها می گذرد، در ابتدا روند پژوهش ها کند بود، اما به مرور با شکل گیری پایگاه های اطلاعاتی بیولوژیکی و درک اهمیت آنها دانشمندان به مطالعات گسترده در این زم...
بررسی وجود ژن هایampC و esbls در سویه های اشریشیاکلی جداسازی شده از موارد انسانی و طیور
سابقه و هدف: آنتی بیوتیک های بتالاکتام در حال حاضر رایج ترین درمان برای عفونت های باکتریایی می باشند. از مهم ترین مکانیسم های مقاومت به این آنتی بیوتیک ها تولید آنزیم های بتالاکتامازی توسط باکتری ها می باشد. هدف از این مطالعه بررسی وجود ژن های بتالاکتامازی ampC و esbl در نمونه های اشریشیا کلی جدا شده از موارد انسانی و طیور می باشد. مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی - توصیفی تعداد 400 نمونه ا...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023